更新時(shí)間:2025-11-27
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1.研究背景:
抗生素耐藥病原體(尤其是多重耐藥菌)的泛濫發(fā)展正威脅著全球公共衛(wèi)生,無(wú)法治療的感染所帶來(lái)的潛在威脅日益顯現(xiàn)。盡管噬菌體療法是對(duì)抗耐藥菌感染的潛在替代方案,但其療效的有力證據(jù)仍不充分。
2.存在的問(wèn)題:
噬菌體療法面臨的挑戰(zhàn)主要源于耐藥性的出現(xiàn),以及其對(duì)抗細(xì)菌長(zhǎng)期感染引發(fā)的免疫抑制狀態(tài)的能力有限。細(xì)菌不僅會(huì)分泌一系列毒性因子抑制免疫細(xì)胞活性,更重要的是,它們會(huì)隱藏并改變自身抗原表位以逃避免疫細(xì)胞識(shí)別,導(dǎo)致感染持續(xù)進(jìn)展。因此,建立噬菌體與免疫系統(tǒng)之間的關(guān)聯(lián),可能為現(xiàn)有噬菌體療法提供突破性方向。
3.解決方法:
本研究開(kāi)發(fā)了一種基于噬菌體的人工抗原導(dǎo)向免疫識(shí)別標(biāo)記納米平臺(tái)(Mn2+@Man-噬菌體),該平臺(tái)通過(guò)在免疫抑制微環(huán)境中搭建細(xì)菌與巨噬細(xì)胞之間的“橋梁",介導(dǎo)免疫級(jí)聯(lián)反應(yīng)的發(fā)生。
4.設(shè)計(jì)思路:
共價(jià)結(jié)合將甘露糖連接子[N-羥基琥珀酰亞胺-聚乙二醇-甘露糖(NHS-PEG-甘露糖)]修飾到噬菌體上(形成Man-噬菌體),并通過(guò)靜電相互作用將錳離子(Mn2?)礦化到噬菌體頭部。噬菌體憑借其固有生物學(xué)特性,對(duì)細(xì)菌具有強(qiáng)大的靶向能力;而甘露糖功能化后,可通過(guò)多價(jià)結(jié)合與巨噬細(xì)胞表面的甘露糖受體作用,進(jìn)一步促進(jìn)免疫細(xì)胞對(duì)細(xì)菌的識(shí)別和吞噬。

實(shí)驗(yàn)分析-表征:

為進(jìn)一步驗(yàn)證Mn2?@Man-噬菌體的表征,研究中采用TEM觀察,發(fā)現(xiàn)制備的Mn2?@Man-噬菌體與裸噬菌體具有相似的規(guī)則結(jié)構(gòu),但形態(tài)發(fā)生改變(圖B),且頭部直徑與尾長(zhǎng)的比例與裸噬菌體存在顯著差異。
紫外-可見(jiàn)(UV-Vis)光譜顯示,Man-噬菌體和Mn2?@Man-噬菌體在260nm處的吸光度升高,這源于(MnCl?)在221nm處的吸收峰以及NHS-PEG-甘露糖在227nm和266nm處的吸收峰(圖C)。
動(dòng)態(tài)光散射(DLS)測(cè)量顯示,裸噬菌體、Man-噬菌體和Mn2?@Man-噬菌體的水動(dòng)力學(xué)直徑分別為162.70±2.29nm、215.27±2.31nm和235.2±1.22nm(圖D)。相應(yīng)地,經(jīng)原位甘露糖化修飾和溫和礦化后,Mn2?@Man-噬菌體的電位較裸噬菌體有所升高,但仍整體帶負(fù)電,且在水溶液中具有良好的分散性和穩(wěn)定性(支撐材料:圖S4A、B)。

Mn2?@Man-噬菌體的元素 mappings顯示碳(C)、氧(O)和錳(Mn)呈特征性分布(圖F),與X射線(xiàn)能譜分析結(jié)果一致(支撐材料:圖S3C),證實(shí)Mn2?已成功礦化到Man-噬菌體頭部。通過(guò)原子力顯微鏡(AFM)進(jìn)一步表征發(fā)現(xiàn),裸噬菌體呈現(xiàn)典型的頭-尾病毒結(jié)構(gòu)(圖G),而經(jīng)甘露糖修飾和Mn2?礦化后,Mn2?@Man-噬菌體的整體輪廓(尤其是頭部)顯著增大(圖H-J)。
通過(guò)噬菌斑計(jì)數(shù)評(píng)估工程化噬菌體的活性,發(fā)現(xiàn)Man-噬菌體和Mn2?@Man-噬菌體的滴度與裸噬菌體相當(dāng)(圖K、L),表明甘露糖化和礦化主要發(fā)生在噬菌體頭部,而噬菌體尾部的完整結(jié)構(gòu)得以保留。
考慮到Mn2?在治療系統(tǒng)中關(guān)鍵的金屬免疫調(diào)控作用,我們通過(guò)電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)評(píng)估Mn2?@Man-噬菌體中Mn2?的釋放情況:在Transwell小室外側(cè)包裹一層10kDa透析膜以建立Mn2?釋放模型(支撐材料:圖S5A);噬菌斑實(shí)驗(yàn)證實(shí),噬菌體無(wú)法透過(guò)透析膜而保留在上室,因此工程化噬菌體頭部釋放的Mn離子可進(jìn)入下室(支撐材料:圖S5B)。
如圖M所示,Mn2?@Man-噬菌體的Mn離子釋放具有pH響應(yīng)性——當(dāng)釋放緩沖液pH從7.0降至5.0時(shí),Mn2?的初始爆發(fā)釋放速率顯著加快。上述數(shù)據(jù)證實(shí),我們成功合成了基于噬菌體的免疫識(shí)別標(biāo)記納米平臺(tái)。
實(shí)驗(yàn)分析-免疫識(shí)別標(biāo)記實(shí)驗(yàn)

將Mn2?@Man-噬菌體與大腸桿菌混合孵育15分鐘后,再與RAW264.7巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)。TEM圖像顯示,Mn2?@Man-噬菌體可錨定在大腸桿菌表面(圖B),表明細(xì)菌標(biāo)記成功。此外,利用異硫氰酸熒光素(FITC)標(biāo)記的Mn2?@Man-噬菌體、1,1'-二十八烷基-3,3,3',3'-四甲基吲哚三碳菁碘化物(DiR)染色的大腸桿菌,以及表達(dá)mCherry的RAW264.7巨噬細(xì)胞,我們通過(guò)可視化觀察發(fā)現(xiàn),RAW264.7巨噬細(xì)胞可識(shí)別并吞噬被標(biāo)記的大腸桿菌,表明Mn2?@Man-噬菌體能在免疫細(xì)胞與病原體之間搭建“橋梁"(圖C)
流式細(xì)胞術(shù)分析顯示,在Man-噬菌體介導(dǎo)下,RAW264.7巨噬細(xì)胞對(duì)大腸桿菌的吞噬活性高于裸噬菌體組(裸噬菌體組吞噬率為44.6%,Man-噬菌體組為56.3%),而Mn2?@Man-噬菌體介導(dǎo)的吞噬率最高(84.3%)(圖D、E),熒光染色和TEM圖像也證實(shí),Mn2?@Man-噬菌體組的RAW264.7巨噬細(xì)胞吞噬作用較顯著(圖F)。

通過(guò)人工抗原評(píng)估RAW264.7巨噬細(xì)胞對(duì)被標(biāo)記細(xì)菌的殺菌能力:瓊脂平板培養(yǎng)和活/死染色結(jié)果顯示,在無(wú)巨噬細(xì)胞參與時(shí),Mn2?@Man-噬菌體的殺菌活性與裸噬菌體相當(dāng)——與對(duì)照組相比,裸噬菌體組和Mn2?@Man-噬菌體組的細(xì)菌菌落數(shù)分別降至56.88±1.90%和57.45±4.67%(支撐材料:圖S6A-C)。
而與RAW264.7巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)24小時(shí)后,Mn2?@Man-噬菌體介導(dǎo)的細(xì)菌存活率顯著降低(圖G)。與對(duì)照組相比,裸噬菌體組、Man-噬菌體組和Mn2?@Man-噬菌體組的胞外細(xì)菌存活率分別為43.04±5.99%、29.53±1.53%和15.04±6.71%,表明Man-噬菌體可在一定程度上介導(dǎo)巨噬細(xì)胞清除胞外細(xì)菌,而Mn2?@Man-噬菌體進(jìn)一步增強(qiáng)了這一效果。
此外,裂解細(xì)胞后收集上清液評(píng)估胞內(nèi)細(xì)菌存活率,發(fā)現(xiàn)Mn2?@Man-噬菌體組與對(duì)照組的差異較顯著,胞內(nèi)細(xì)菌存活率僅為6.18±2.26%(圖G、H)。值得注意的是,即使是噬菌體耐藥菌,經(jīng)納米平臺(tái)標(biāo)記后,仍能被RAW264.7巨噬細(xì)胞有效吞噬和殺傷(支撐材料:圖S7)。
實(shí)驗(yàn)分析-金屬免疫調(diào)控

在各類(lèi)細(xì)胞群體中,巨噬細(xì)胞的優(yōu)勢(shì)亞群決定了機(jī)體抗感染免疫的方向。M1型活化巨噬細(xì)胞最初被認(rèn)為在對(duì)抗入侵病原體中起關(guān)鍵作用;而細(xì)菌長(zhǎng)期感染會(huì)觸發(fā)巨噬細(xì)胞從促炎狀態(tài)向免疫抑制狀態(tài)(M2型表型)轉(zhuǎn)變,從而促進(jìn)感染持續(xù)發(fā)展。已有研究證實(shí),錳(Mn2?)等營(yíng)養(yǎng)金屬離子可激活環(huán)磷酸鳥(niǎo)苷-腺苷合成酶-干擾素基因刺激因子(cGAS-STING)通路,增強(qiáng)免疫效能。
利用Mn2?釋放模型,分析RAW264.7巨噬細(xì)胞的極化狀態(tài):將M0型和M2型RAW264.7巨噬細(xì)胞分別在Mn2?釋放模型的下室培養(yǎng)24小時(shí)。
流式細(xì)胞術(shù)分析證實(shí),Mn2?@Man-噬菌體釋放的Mn2?顯著提高了M0型RAW264.7巨噬細(xì)胞中M1/M2標(biāo)志物(CD86/CD206、iNOS/Arg-1)的比值。
同時(shí),Mn2?@Man-噬菌體組的M2型RAW264.7巨噬細(xì)胞被有效重編程為殺菌表型:CD86?和iNOS?巨噬細(xì)胞比例分別從31.7%和3.56%升至53.2%和24.7%,而CD206?和Arg-1?巨噬細(xì)胞比例分別從82.8%和21.2%降至43.2%和10.4%(圖D、E)。

上述數(shù)據(jù)表明,釋放的Mn2?可促進(jìn)M0型和M2型巨噬細(xì)胞向M1型極化。為了進(jìn)一步探究Mn2?@Man-噬菌體釋放的Mn2?對(duì)RAW264.7巨噬細(xì)胞中cGAS-STING通路及下游核因子κB(NF-κB)通路的影響。
Western blotting結(jié)果顯示,Mn2?顯著誘導(dǎo)STING、TANK結(jié)合激酶1(TBK1,促進(jìn)NF-κB激活的結(jié)合蛋白)和p65的磷酸化(圖F)。
研究證實(shí),Mn2?可激活p65核轉(zhuǎn)位,進(jìn)而促進(jìn)腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、IL-6、IL-1β和IL-12等促炎細(xì)胞因子的轉(zhuǎn)錄和分泌(圖G、H)。
這表明,在Mn2?@Man-噬菌體介導(dǎo)巨噬細(xì)胞識(shí)別和吞噬細(xì)菌的過(guò)程中,釋放的Mn2?可通過(guò)激活cGAS-STING-NF-κB通路,將巨噬細(xì)胞重編程為M1型,進(jìn)一步增強(qiáng)其抗菌能力。
實(shí)驗(yàn)分析-轉(zhuǎn)錄組分析
深入探究Mn2?@Man-噬菌體誘導(dǎo)的基因組變化,采用RNA測(cè)序分析其轉(zhuǎn)錄組圖譜。
火山圖顯示,Mn2?@Man-噬菌體處理后共鑒定出2200多個(gè)差異表達(dá)基因(DEG),且這些基因主要參與促炎應(yīng)答(圖A)。KEGG富集分析顯示,Mn2?@Man-噬菌體處理后,免疫相關(guān)激活通路中候選基因的富集因子變化較為顯著,包括IL-17、TNF、NF-κB和核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域(NOD)樣信號(hào)通路(圖5B)?;蚣患治觯℅SEA)結(jié)果與之一致,進(jìn)一步證實(shí)RAW264.7巨噬細(xì)胞對(duì)病原體的激活效應(yīng)(圖C)。
轉(zhuǎn)錄圖譜熱圖顯示,Mn2?@Man-噬菌體處理后,巨噬細(xì)胞中免疫激活相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),包括抗原呈遞共刺激分子(如CD40、CD80、CD86、Icosl)和促炎細(xì)胞因子(如IL-6、IL-1β、Nos2、TNF-α、IL-12)的轉(zhuǎn)錄水平廣泛升高(圖D)。此外,實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)檢測(cè)也發(fā)現(xiàn),促炎基因(Tnfa、Il1b、Nos2)的表達(dá)呈顯著上調(diào)趨勢(shì)(圖E)。
此外,基因本體論(GO)數(shù)據(jù)庫(kù)分析顯示,上調(diào)基因與巨噬細(xì)胞表型和金屬離子結(jié)合相關(guān)——生物學(xué)過(guò)程和分子功能的頂級(jí)富集術(shù)語(yǔ)包括巨噬細(xì)胞激活、促炎應(yīng)答、Mn2?結(jié)合以及免疫應(yīng)答相關(guān)細(xì)胞因子產(chǎn)生(圖F)。

實(shí)驗(yàn)分析-靶向潛力探究


為探究Mn2?@Man-噬菌體的感染靶向潛力,在單只小鼠上進(jìn)行了對(duì)比建模實(shí)驗(yàn):右側(cè)脛骨植入無(wú)菌物體,左側(cè)脛骨植入被大腸桿菌污染的植入物(圖A)。大腸桿菌感染24小時(shí)后,向小鼠靜脈注射裸噬菌體和Mn2?@Man-噬菌體,并利用活體熒光成像系統(tǒng)(IVIS)檢測(cè)其分布。
如圖B、C所示,注射后2小時(shí)即可在感染脛骨處觀察到熒光信號(hào),且信號(hào)強(qiáng)度隨時(shí)間逐漸增強(qiáng),在注射后12小時(shí)達(dá)到峰值;而未感染部位的熒光信號(hào)無(wú)顯著變化。這些結(jié)果表明,Mn2?@Man-噬菌體可精準(zhǔn)結(jié)合大腸桿菌,從而實(shí)現(xiàn)細(xì)菌清除和免疫調(diào)控。
此外,我們?cè)u(píng)估了Mn2?@Man-噬菌體的治療效果(圖D)。治療后第7天,接受Mn2?@Man-噬菌體治療的小鼠感染嚴(yán)重程度顯著減輕:蘇木精-伊紅(H&E)染色和吉姆薩染色顯示,骨髓中中性粒細(xì)胞浸潤(rùn)和細(xì)菌載量顯著降低(圖E);掃描電子顯微鏡(SEM)結(jié)果顯示,Mn2?@Man-噬菌體組植入物上的細(xì)菌菌落被顯著清除(圖E)。
同時(shí),膝關(guān)節(jié)腫脹減輕、膝關(guān)節(jié)周長(zhǎng)縮小、體重恢復(fù)以及組織學(xué)評(píng)分降低,均表明Mn2?@Man-噬菌體具有優(yōu)異的抗菌效果(圖F-I)。
瓊脂平板培養(yǎng)結(jié)果與上述一致:Mn2?@Man-噬菌體處理后,骨髓和植入物中的細(xì)菌菌落數(shù)均大幅減少。與對(duì)照組相比,Mn2?@Man-噬菌體組骨髓和植入物中的細(xì)菌計(jì)數(shù)均降低6個(gè)數(shù)量級(jí),而裸噬菌體組僅降低4個(gè)數(shù)量級(jí)(圖J)。
實(shí)驗(yàn)分析-免疫機(jī)制

免疫熒光染色圖像顯示,Mn2?@Man-噬菌體可介導(dǎo)巨噬細(xì)胞向M1型極化,表現(xiàn)為CD86和iNOS表達(dá)升高(圖B、C)。
M1型極化巨噬細(xì)胞在宿主抗感染防御中起重要作用:它們遷移至感染部位后,識(shí)別并吞噬入侵細(xì)菌,隨后發(fā)揮細(xì)胞毒性作用,并向適應(yīng)性免疫細(xì)胞呈遞抗原。同時(shí),CD4?和CD8?T細(xì)胞的級(jí)聯(lián)激活需要M1型巨噬細(xì)胞提供充足的抗原呈遞。
Mn2?@Man-噬菌體治療后,免疫組化染色顯示骨髓中CD4?和CD8?T細(xì)胞浸潤(rùn)增加,表明Mn2?@Man-噬菌體激活的巨噬細(xì)胞可通過(guò)吞噬細(xì)菌并向T細(xì)胞呈遞抗原,促進(jìn)T細(xì)胞激活(圖D、E)。

此外,通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)全面分析了骨髓中的免疫細(xì)胞組成及免疫圖譜變化:與上述結(jié)果一致,Mn2?@Man-噬菌體治療顯著誘導(dǎo)骨髓中的巨噬細(xì)胞向殺菌表型轉(zhuǎn)變(圖F、G);Mn2?@Man-噬菌體組中iNOS?F4/80?細(xì)胞比例升至10.7%(對(duì)照組為4.62%),而Arg-1?F4/80?巨噬細(xì)胞比例降低約一半(圖J)。
Mn2?@Man-噬菌體治療后,感染部位CD4?和CD8?T細(xì)胞比例顯著增加,表明適應(yīng)性免疫應(yīng)答被激活(圖H、I);且Mn2?@Man-噬菌體顯著增強(qiáng)T細(xì)胞活性——IFN-γ?CD4?和IFN-γ?CD8?T細(xì)胞比例分別是其他組的4倍和3倍(圖K)。脛骨骨髓懸液的酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)結(jié)果顯示,Mn2?@Man-噬菌體組中TNF-α、IL-12和IFN-γ水平顯著升高,而IL-10水平相應(yīng)降低(圖L)。
5.研究結(jié)論
本研究基于噬菌體捕食的固有機(jī)制,提出了一種創(chuàng)新的抗細(xì)菌感染噬菌體免疫療法——該療法通過(guò)在宿主免疫抑制微環(huán)境中重建細(xì)菌與巨噬細(xì)胞之間的“橋梁",介導(dǎo)抗感染免疫級(jí)聯(lián)反應(yīng)的發(fā)生。所有數(shù)據(jù)均證實(shí),我們的納米平臺(tái)可有效激活免疫應(yīng)答,實(shí)現(xiàn)細(xì)菌清除。此外,研究結(jié)果表明,經(jīng)修飾的噬菌體可作為細(xì)菌表面的“人工抗原",用于宿主細(xì)胞免疫監(jiān)視;且該治療系統(tǒng)可擴(kuò)展應(yīng)用于多種免疫細(xì)胞和病原體。
鑒于傳統(tǒng)抗生素替代方案的迫切需求,本策略通過(guò)整合免疫治療特性,為噬菌體療法帶來(lái)創(chuàng)新,為其在臨床感染治療中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。
6.創(chuàng)新點(diǎn)
機(jī)制創(chuàng)新:揭示噬菌體單獨(dú)療法的局限:不能有效激活宿主免疫,導(dǎo)致耐藥菌和免疫抑制環(huán)境持續(xù)存在。提出通過(guò)“人工抗原標(biāo)記"重建細(xì)菌與免疫系統(tǒng)的連接。
材料策略創(chuàng)新:將噬菌體殘留衣殼“二次利用"為人工免疫標(biāo)記載體。引入 甘露糖+Mn2? 雙功能化:甘露糖增強(qiáng)巨噬細(xì)胞受體識(shí)別。Mn2?作為免疫金屬因子,觸發(fā) cGAS-STING 信號(hào),推動(dòng) M1 極化。
治療模式創(chuàng)新:不再僅依賴(lài)噬菌體直接裂解,而是通過(guò)“噬菌體-宿主免疫雙橋梁"實(shí)現(xiàn)細(xì)菌清除。同時(shí)激活 先天免疫(巨噬細(xì)胞)+ 適應(yīng)性免疫(T細(xì)胞),構(gòu)建系統(tǒng)性免疫反應(yīng)。
該策略可適配多種噬菌體,不限于單一病原體,甚至可與噬菌體雞尾酒聯(lián)合??山玉g不同免疫配體,具備較高的可擴(kuò)展性與轉(zhuǎn)化潛力。
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